Данный протокол применяется у взрослых с хронической лихорадкой Ку, у которых имеется эндокардит или сосудистая инфекция. Данная клиническая форма представляет собой тяжёлое, установленное проявление хронического заболевания и требует специфического, основанного на доказательной медицине подхода к лечению, отличного от подходов при неосложнённой инфекции.
Структурированный протокол предусматривает комбинированный пероральный режим антибиотикотерапии, требующий длительного курса лечения. Оба препарата и точная продолжительность лечения определены в полном протоколе.