यह प्रोटोकॉल तीव्र पायलोनेफ्राइटिस के उन रोगियों पर लागू होता है जिनकी नैदानिक गंभीरता अस्पताल में भर्ती और अंतःशिरा रोगाणुरोधी आहार की शुरुआत की आवश्यकता बताती है।
प्रारंभिक कल्चर परिणामों में बहु-औषध प्रतिरोधी जीवों का संकेत मिलने वाले रोगियों में, एक अंतिम विकल्प पैरेंटेरल थेरेपी उपलब्ध है। इस चरण पर चयनात्मक रूप से विचार किया जाता है — विशिष्ट एजेंट और आहार पूर्ण प्रोटोकॉल में परिभाषित हैं।
प्रबंधन अंतःशिरा रोगाणुरोधी थेरेपी से शुरू होता है। जिन मामलों में प्रारंभिक कल्चर बहु-औषध प्रतिरोधी जीवों की पुष्टि करता है, उनमें चयनित अंतिम-पंक्ति पैरेंटेरल एजेंट संकेतित हैं — पूर्ण प्रोटोकॉल विस्तार से बताता है कि कौन से एजेंट किन परिस्थितियों में लागू होते हैं।