يُطبَّق هذا البروتوكول على المرضى المصابين بحمى معوية شديدة أو معقدة — بما فيهم المرضى الذين يعانون من مرض شديد، أو عدم القدرة على تحمّل العلاج الفموي بسبب القيء و/أو الإسهال الشديد، أو المضاعفات المعوية وخارج المعوية — حيث يكون الكائن المُسبِّب للعدوى حساساً لسيبروفلوكساسين. يحتاج هؤلاء المرضى عادةً إلى الاستشفاء وتلقّي العلاج الميكروبي الوريدي.
عندما يكون الكائن المُسبِّب حساساً لسيبروفلوكساسين، فإن العلاج الميكروبي الوريدي القائم على سيبروفلوكساسين هو النهج الموصى به لعلاج الحمى المعوية الشديدة، إذ يحدد البروتوكول الكامل إدارة المرضى من الأطفال والبالغين ويتناول المضاعفات المعوية المهددة للحياة.