يُمثّل داء البارغونيموس الدماغي حالةً سريريةً نادرةً لكنها خطيرة، إذ يهاجر فيها الطفيل إلى الجهاز العصبي المركزي، مما يستلزم نهجاً علاجياً مُصمَّماً خصيصاً لهذا الموقع من الإصابة.
يُعالج هذا البروتوكول المرضى المصابين بـ داء البارغونيموس الدماغي — أي إصابة الدماغ أو الجهاز العصبي المركزي. يُفرز الموقع الدماغي اعتبارات إدارية إضافية تتجاوز المرض الرئوي المعتاد، إذ يمكن للطفيل الميت أن يُثير استجابةً التهابيةً محليةً كبيرة داخل الجهاز العصبي المركزي.
يرتكز العلاج على العلاج المضاد للطفيليات عن طريق الفم باستخدام البرازيكوانتيل. في حالات الإصابة الدماغية، يُقرن هذا العلاج بدورة من الكورتيكوستيرويدات للحد من الاستجابة الالتهابية حول الديدان الميتة — وهو اعتبار جوهري يُميّز هذا النوع من الإصابة عن داء البارغونيموس الرئوي غير المعقد.