في مجموعة فرعية من مرضى الحمى المتوسطية العائلية، يتطور إشراك المفاصل المزمن بوصفه مضاعفةً مستمرة — مختلفةً عن النمط الدوري المعتاد للنوبات، وتستلزم علاجاً مخصصاً يتجاوز الإدارة القياسية.
يُصاب نحو 5% من مرضى الحمى المتوسطية العائلية بإشراك مزمن للمفاصل، يشبه في أغلب الأحيان التهاب الفقار المحوري مع التهاب المفصل العجزي الحرقفي والتهاب المفصل الواحد أو قليل المفاصل في الأطراف. لا يكون العلاج القياسي بالكولشيسين فعّالاً دائماً في هذه الصورة من التهاب المفاصل المزمن، وتستلزم الحالات غير المستجيبة تدخلاً إضافياً.
حين يستمر التهاب المفاصل المزمن لدى مرضى الحمى المتوسطية العائلية، يتضمن البروتوكول عوامل علاجية إضافية — منها العقاقير المعدِّلة للأمراض الروماتيزمية، وحقن الستيرويد داخل المفصل، أو العوامل البيولوجية. وتُحدَّد معايير الاختيار والتسلسل ونقاط القرار المحددة في البروتوكول الكامل.