يغطي هذا البروتوكول إدارة مرض فيروس إيبولا عند وجود تعدوى بكتيرية مصاحبة في حديث الولادة. يمثل حديثو الولادة فئة سكانية متميزة: يستلزم اختيار المضادات الحيوية وفترات الجرعات ومدة العلاج تعديلات خاصة بالعمر والوزن تختلف اختلافاً جوهرياً عن الأطفال الأكبر سناً والبالغين.
يتمحور العلاج حول العلاج المضاد للحيوي المشترك الذي يجمع بين بيتا-لاكتام وأمينوغليكوزيد. تُنظر في تركيبات بيتا-لاكتام بديلة عند الاشتباه السريري بمسبب بعينه، كالمكورات العنقودية الذهبية Staphylococcus aureus. بعض فئات المضادات الحيوية المستخدمة بشكل روتيني في المرضى الأكبر سناً تنطوي على خطر متزايد في حديثي الولادة ولا يُنصح بها لهذه الفئة العمرية.