يتعافى التهاب الكبد الحاد E في الغالب دون تدخل علاجي محدد، غير أن مجموعة فرعية ذات أهمية سريرية تظهر بمرض حاد شديد أو تتطور إلى قصور الكبد الحاد على المزمن — وهي حالة عالية الخطورة تستوجب اعتبارات علاجية موجَّهة.
في حالات التهاب الكبد الحاد E الشديد أو قصور الكبد الحاد على المزمن، يمكن النظر في استخدام عامل مضاد للفيروسات. تعتمد المؤشرات على الشدة السريرية؛ ولم يُوحَّد حتى الآن الجرعة المحددة لهذا العامل ولا مدة استخدامه، وقد وُضِع إطار القرار الكامل في البروتوكول المنظَّم.
الخطة العلاجية الكاملة ومعايير الاختيار والخوارزمية السريرية متاحة في البروتوكول أدناه.يستهدف العلاج التطبيع السريع لإنزيمات الكبد وجعل الحمض النووي الريبي لفيروس HEV غير قابل للكشف في الدم في غضون أيام قليلة من بدء العلاج.